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免費在線系列講座-CADD在小分子藥物研發中的應用
點擊次數:1643 發布日期:2020-3-27  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
近幾十年來,隨著計算機科學技術的發展,計算機輔助藥物設計(CADD)已成為新藥研究的重要手段之一,通過計算機輔助手段,可以有效地加速先導化合物的發現和優化,縮短藥物研究與開發的周期,有效地降低開發成本??店攀⑹親ㄎ蒲Я煊蛞約把蟹⒒固峁┬畔⒀Р芳爸С?,在計算機輔助藥物設計領域有出色的產品以及解決方案的公司。在疫情特殊時期,為了讓廣大對CADD感興趣的藥物研發科研工作者能便捷地了解、學習CADD技術在小分子藥物研發中的應用,康昱盛將在2020年4月-5月舉辦四期免費的在線系列講座。
 
主辦單位:

上??店攀⑿畔⒖萍加邢薰?br />

主講人:

林偉昱,產品經理
盛亞運,高級應用工程師
肖新哲,應用工程師

時間:

2020年4月2日(周四)15:00-16:00;
2020年4月16日(周四)15:00-16:00;
2020年4月30日(周四)15:00-16:00;
2020年5月14日(周四)15:00-16:00

授課方式:

免費網絡授課

課程安排:                          

第一講:In Silico Fragment-Based Drug Design: Approaches and Applications

2020年4月2日(周四)15:00-16:00

基于片段的藥物設計是一種發現高質量候選藥物的關鍵方法。作為對生物物理學的FBDD方法的補充,計算機模擬的FBDD采用基于結構的方法快速設計和篩選大的虛擬化合物庫,考慮了更大化學空間的探索。

本次講座將主要介紹基本的計算機模擬FBDD方法,涵蓋了從組合片段庫設計,到受體活性口袋的骨架躍遷、片段連接和生長。同時我們還將展示在MOE中如何通過基于反應的組合庫設計和藥化轉化規則生成一系列相關聯的衍生物,以及討論如何利用藥效團模型和2D/3D描述符來指導計算機模擬的FBDD過程。



 
第二講:StarDrop BIOSTER:Automatic Compound Generation with Improved Properties

2020年4月16日(周四)15:00-16:00

       小分子藥物設計、優化和數據分析平臺StarDrop可以為用戶帶來極佳的交互式分子設計體驗,利用StarDrop的分子設計??镹ova和化學經驗知識庫BIOSTER,用戶可以基于多種方法全自動生成性質更佳的候選分子,并兼顧候選分子的可合成性。

       本次講座將主要介紹利用StarDrop來進行藥物分子de novo設計的方法,涵蓋化合物創意轉化功能、匹配系列分析以及虛擬庫枚舉,并利用StarDrop特有的多參數評價方法和強大的交互式設計功能,來指導如何通過StarDrop全自動生成性質更均衡、更具化學創意的候選化合物。


 
第三講:StarDrop P450 Foreseeing Molecules: Additional P450 Prediction Guiding in silico Drug Design

2020年4月30日(周四)15:00-16:00

       作為全球領先的藥物代謝預測軟件,StarDrop的代謝預測??镻450廣受全球用戶的青睞。現今,P450??榧唇讜湊攵云咧種饕赴豍450酶亞型基礎上增加更多預測模型,包含黃素單加氧酶(FMO)和尿苷二磷酸葡萄糖醛酸糖基轉移酶(UGT)預測模型。

       本次講座將為您展示利用StarDrop的P450??榻幸┪锎輝げ餳昂蜓》腫癰腦斕墓δ?,并展示全新的FMO和UGT預測模型。聯合頂尖的毒性預測??镈erek Nexus,幫助您在模擬階段既可評估藥物分子及代謝產物的各項ADME性質及毒性,幫助您獲得性質更優、毒性更小的候選分子。


第四講:Small Molecule Virtual Screening

2020年5月14日(周四)15:00-16:00

虛擬篩選 (Virtual Screening, VS) 是基于小分子數據庫開展的活性化合物篩選。利用小分子化合物與藥物靶標間的分子對接運算,虛擬篩選可快速從幾十至上百萬分子中,遴選出具有成藥性的活性化合物,大大降低實驗篩選化合物數量,縮短研究周期,降低藥物研發的成本。據報道虛擬篩選的陽性率為5%-30%,利用虛擬篩選成功輔助藥物設計的案例逐年增多,虛擬篩選已成為目前最有潛力的藥物開發工具。

本次講座將系統介紹虛擬篩選的基本原理和一般流程,并以2019新冠病毒3CL水解酶晶體結構(PDB code:6LU7)為例,通過MOE的多個??檠菔敬蠹銥燜俚厴釗肓私夂褪煜ば檣傅木嚀宀僮?。


如何報名:

如果您計劃參加,可以通過以下四種方式報名,為保證講課質量,報名人數有限,建議您提前報名!

1. 進入康昱盛官方網站 //www.cloudscientific.com/plus/view.php?aid=380,進入活動頁面,點擊左下角“我要報名sign up"。
2. 將 “CADD+姓名+單位+郵箱+電話+研究方向”發送到[email protected],即可。
3. 關注“康昱盛”公眾號,發送CADD+姓名+單位+郵箱+電話+研究方向”到公眾號報名。


 
4. 直接通過電話報名,電話: 021- 54975000

備注:您提交報名信息后,我們會在一個工作日內通過電話或者微信聯系您,并在網絡講座開始當日為您提供網絡授課地址,您可以與您的同學或同事共享學習!
 
 
關于MOE (Molecular Operating Environment)

MOE是由加拿大CCG公司開發的功能全面、強大的分子模擬及藥物設計綜合軟件,它是目前市場上最被廣泛應用的一個軟件包,世界排名前50的生物醫藥研發公司都在用這套軟件系統;在科研領域每年引用這個軟件發表的高水平文章多達近千篇。MOE集可視化、模擬和應用開發于一體,可以輕松、靈活地用于基于結構和基于片段的藥物設計,藥效團的發現和篩選,藥物化學的應用,生物藥的應用,蛋白和抗體的建模,分子建模和模擬,化學信息學和定量構效關系,以及定制化開發等等。

關于StarDrop

StarDrop是一個用于在藥物發現中輔助決策、幫助項目組快速確定高質量化合物的軟件。
StarDrop用于評估復雜的數據,這些數據通常由于實驗或預測產生的誤差而具有一定的不確定性。在對數據進行評分時,StarDrop給您帶來可靠與直觀簡潔的方法,以幫助做出決策:哪些化合物是您需要優先考慮開發的。StarDrop良好的交互式工具可以幫助您有效地開拓改進化合物的途徑。通過其高度可視化、易于使用的界面,StarDrop將指導您完成每個階段的化合物選擇和設計過程。StarDrop獨特的Card View為您提供了自由的環境去探索、管理您的項目數據,根據您自己的想法獲取化合物之間的關系;不再受限于表格和列表,從而能快速地找到高質量的化合物和新的優化策略。
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